Apesar de ser admissível a utilização de outros instrumentos no culto divino, o Concílio Vaticano II manteve clara preferência pelo órgão: "Na Igreja latina tenha-se em grande estima órgão de tubos, instrumento musical tradicional, cujo som é capaz de acrescentar um esplendor notável às cerimónias da Igreja e de elevar poderosamente os ânimos para Deus e para as realidades celestes" (SC 120).
A AMSB disponibiliza para aqueles que terminaram os Cursos Complementares de Música Litúrgica, nas variantes de Canto, Órgão ou Direção Coral, a hipótese de continuarem a desenvolver as suas capacidades musicais através da Formação Contínua.